本科论文查重率过高可能会影响奖学金的评定。高查重率表明论文原创性不足，可能被认定为抄袭，从而影响奖学金评定。建议学生在写作过程中注意引用规范，避免过高的查重率。此外，可通过修改论文内容、增加原创性等方式降低查重率，提高论文质量。

另外，学生也可以通过使用专业的查重软件自行检测论文的重复率，及时发现问题并进行修改。同时，可以向导师寻求帮助，进行论文修改和提升原创性。综上所述，本科论文查重率过高会对奖学金产生一定影响，因此学生在撰写论文时务必注意原创性，避免抄袭行为。